Авторы TechPowerUp не поленились и протестировали карту со всеми вариантами PCIe, начиная с первого. 

Как можно видеть, использовать RTX 5090 с PCIe 1.1 или 2.0 будет не очень здравой идеей, хотя сложно себе представить такой ПК. Но вот уже PCIe 3.0 снизит производительность всего на 2-4%, а разницы между PCIe 4.0 и 5.0 условно нет вообще. Стоит также отметить, что во всех случаях речь о полной версии с 16 линиями.  

То есть владельцам платформ с PCIe 4.0 нет никакого смысла переживать, что это будет ограничением для RTX 5090, да и PCIe 3.0 будет вполне достаточно.