Он был ликвидирован ударным дроном в своём доме в центре Кабула, Афганистан. При этом никто больше не пострадал. Операция проходила без спецназа, наземной поддержки и военных баз рядом.

Удар, нанесенный беспилотником ВВС ЦРУ, был выполнен в 6:18 утра в воскресенье по местному времени в Кабуле, когда лидер «Аль-Каиды» стоял на балконе своего дома. На подтверждение устранения цели ушло пару дней.

В своём заявлении президент США Джо Байден сказал, что дал окончательное согласие на убийство Аймана аль-Завахири, который все еще планировал нападения на США и их союзников: «Правосудие восторжествовало, и этого лидера террористов больше нет».