Huawei Nova 9 SE оснащен 6,78-дюймовым ЖК-дисплеем IPS с отверстием в центральной верхней части. Экран имеет разрешение Full HD+ (1080 x 2388 пикселей), частоту обновления 90 Гц и частоту дискретизации касания 240 Гц. На передней панели Nova 9 SE расположена 16-мегапиксельная камера. Задняя панель имеет 108-мегапиксельную основную камеру, которая соединена с 8-мегапиксельным сверхширокоугольным модулем, 2-мегапиксельным датчиком глубины и 2-мегапиксельной макрокамерой.

Телефон работает под управлением фирменной оболочки EMUI 12, в нём отсутствуют приложения и сервисы Google. Телефон оснащён аккумуляторной батареей емкостью 4000 мА•ч, которая поддерживает быструю зарядку мощностью 66 Вт. Устройство поставляется с 8 ГБ оперативной памяти и 128 или 256 ГБ флеш-памяти. Есть поддержка двух SIM-карт, 4G VoLTE, Wi-Fi 802.11ac, Bluetooth 5.0, GPS, NFC и порт USB-C. Телефон получил боковой сканер отпечатков пальцев.

Huawei Nova 9 SE доступен в трех цветах : Crystal Blue, Pearl White и Midnight Black. Цены пока не сообщаются.